Seit jeher sind Mäuse, Ratten und Schaben Untermieter beim Menschen – Parasiten also, die sich hervorragend an das jeweilige Umfeld anpassen konnten. „Blinde Passagiere" spielt unter anderem in einem Navajo-Reservat in New Mexico, im mittelalterlichen Venedig, am Umweltbundesamt in Berlin, im Hafen von New York und im Vorratsraum eines historischen Segelschiffes im Mittelmeer. 

Der Film erzählt die Geschichte vom engen Zusammenleben mit den Vorratsschädlingen, von Abscheu und Ekel, vom immerwährenden Kampf der Menschen gegen ihre ungeliebten Untermieter. Und dennoch erlaubt die Dokumentation einen faszinierenden Blick auf diese Tiere, zeigt deren biologische Lebenszyklen, ihre Ernährungsweise, ihre Anpassungsmechanismen und parasitären Verhaltensweisen.